Musée de site dès sa création en 1838, le Musée romain d’Avenches voit ses collections augmenter régulièrement au gré des fouilles préventives conduites dans l’emprise du site antique. Il s’agit surtout de mobilier archéologique, souvent assez fragmentaire, mais aussi parfois d’objets considérés comme plus prestigieux : une mosaïque en 2018 ou un glaive à manche en ivoire en 2019, pour ne citer que des exemples récents. Le Musée n’a par contre pas de politique d’acquisition d’oeuvres et, de par la nature de ses collections, ne reçoit que rarement des dons qui viendraient enrichir ces dernières. Le corollaire de cet état de fait est que les collections sont parfaitement « propres » et qu’aucun objet n’a des origines douteuses, telles que pillage de sites archéologiques ou appropriation indue à l’époque où l’Europe colonisait d’autres continents.